[Biochemical kinetic simulation software]

El programa GEPASI es capaz de simular el estado estacionario y el comportamiento a lo largo del tiempo de las reacciones en varios compartimientos de volm͠enes distintos. El usuario suministra al programa con informacin̤ acerca de la estructura estequiomťrica de la ruta y la cinťica de cada reacc...

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Other Authors: Mendes Pedro, Aberystwyth Quantitative Biology and Analytical Biotechnology Group
Format: Book
Language:English
Subjects:
Online Access:[Biochemical kinetic simulation software]
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245 1 0 |a [Biochemical kinetic simulation software] 
246 |a [Software de simulacin̤ cinťica bioqum̕ica] 
264 |a Bogot ̀(Colombia) :  |b Revista VirtualPRO,  |c 2004 
520 3 |a El programa GEPASI es capaz de simular el estado estacionario y el comportamiento a lo largo del tiempo de las reacciones en varios compartimientos de volm͠enes distintos. El usuario suministra al programa con informacin̤ acerca de la estructura estequiomťrica de la ruta y la cinťica de cada reaccin̤, volm͠enes de los compartimientos, y concentracin̤ inicial de todas las especies qum̕icas. As,̕ el programa construye las ecuaciones diferenciales que gobiernan el comportamiento del sistema y los resuelve. Los resultados se producen en una forma flexible, de tal forma que los datos puedan ser importados a hojas de cl̀culo u otros programas de procesamiento de datos. Estos datos pueden ser graficados en grf̀icos 2D o 3D directamente desde el programa. GEPASI tiene la habilidad de hacer barrido (scanning) intervalos de valores de los parm̀etros del sistema, y producir un mapeo del comportamiento del sistema dentro de estos intervalos. GEPASI caracteriza los estados estacionarios que encuentra empleando Anl̀isis de Control Metabl̤ico y anl̀isis de estabilidad cinťica lineal. Caracters̕ticas - GEPASI es un software gratis (ver licencia del usuario) - GEPASI corre bajo Microsoft Windows (95 y ms̀ actualizados) -Los modelos en GEPASI pueden estar compuestos de muchos compartimientos con diferentes volm͠enes -El nm͠ero de reacciones y metabolitos en cada modelo esta limitado solamente por la memoria disponible. Se pueden seguir la simulaciones interactivamente (incluyendo perturbaciones adicionales al tiempo en curso) -GEPASI caracteriza estados estacionarios empleando Metabolic Control Analysis (Anl̀isis de Control Metabl̤ico) y anl̀isis de estabilidad lineal -La utilidad de barrido de GEPASI proporciona una forma para la exploracin̤ avanzada de un comportamiento de modelo en un espacio de parm̀etro multidimensional - GEPASI es capaz de realizar ajustes de datos (estimacin̤ de parm̀etros) con datos experimentales GEPASI es capaz de encontrar mx̀imos o mn̕imos de cualquiera de las variables del modelo con cualquier nm͠ero de parm̀etros de modelo ajustables. -Los resultados de las simulaciones pueden ser graficados en 2D y 3D directamente del programa (GEPASI usa el excelente paquete Gnuplot) -GEPASI soporta SBLM nivel 1 para el inter-cambio de modelo con otro software de modelamiento de sistemas biolg̤icos. SBLM es un lenguaje comn͠, de descripcin̤ basada en modelos para software de simulacin̤ de sistemas biolg̤icos. Se emplea principalmente para el intercambio de modelos entre distintos software. SBLM fue desarrollado por la Caltech unit del ERATO Kitano project, con una entrada frecuente de la comunidad (incluyendo al Biochemical Networks Modeling Group)... 
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